incompatibilitatea aplicatiilor ce ruleaza pe windows , poate fi un avantaj sau un dezavantaj spre exemplu : un virus banal , nu te va afecta pe linux , deoarece marea majoritate sunt ganditi pentru a rula pe sisteme de operare Windows ar fi un dezantaj spre exemplu daca ai avea nevoie neaparat de o aplicatie care ruleaza doar pe windows , sa zicem Photoshop ( habar n-am , poate au versiuni si de Linux ) ... Totusi , dezavantajul poate fi " neutralizat " sa zicem , folosind Cedega sau Wine .